1. Home
  2. Author
  3. Report for Cole ST

Report for Cole ST

General

Full name :

First name :

Mail :

Zip Code :

City :

Country :

Email :

Phone :

Fax :

Website :

Directory :

References (16)

Title : TubercuList--10 years after - Lew_2011_Tuberculosis_91_1
Author(s) : Lew JM , Kapopoulou A , Jones LM , Cole ST
Ref : Tuberculosis (Edinb) , 91 :1 , 2011
Abstract : Lew_2011_Tuberculosis_91_1
ESTHER : Lew_2011_Tuberculosis_91_1
PubMedSearch : Lew_2011_Tuberculosis_91_1
PubMedID: 20980199
Gene_locus related to this paper: myctu-ephA , myctu-ephB , myctu-LPQP , myctu-Rv0160c , myctu-Rv2485c , myctu-RV2695 , myctu-RV2765 , myctu-RV2800 , myctu-Rv3097c

Title : Comparative genomic and phylogeographic analysis of Mycobacterium leprae - Monot_2009_Nat.Genet_41_1282
Author(s) : Monot M , Honore N , Garnier T , Zidane N , Sherafi D , Paniz-Mondolfi A , Matsuoka M , Taylor GM , Donoghue HD , Bouwman A , Mays S , Watson C , Lockwood D , Khamesipour A , Dowlati Y , Jianping S , Rea TH , Vera-Cabrera L , Stefani MM , Banu S , MacDonald M , Sapkota BR , Spencer JS , Thomas J , Harshman K , Singh P , Busso P , Gattiker A , Rougemont J , Brennan PJ , Cole ST
Ref : Nat Genet , 41 :1282 , 2009
Abstract : Monot_2009_Nat.Genet_41_1282
ESTHER : Monot_2009_Nat.Genet_41_1282
PubMedSearch : Monot_2009_Nat.Genet_41_1282
PubMedID: 19881526
Gene_locus related to this paper: mycle-a85a , mycle-a85b , mycle-a85c , mycle-lipG , mycle-metx , mycle-ML1632 , mycle-ML2297 , mycle-ML2603 , mycle-MLC1351.21C , mycle-MLCB22.16c , mycle-mpt5 , mycle-q9cc62 , mycle-q9cdb3 , mycle-tpea

Title : Insights from the complete genome sequence of Mycobacterium marinum on the evolution of Mycobacterium tuberculosis - Stinear_2008_Genome.Res_18_729
Author(s) : Stinear TP , Seemann T , Harrison PF , Jenkin GA , Davies JK , Johnson PD , Abdellah Z , Arrowsmith C , Chillingworth T , Churcher C , Clarke K , Cronin A , Davis P , Goodhead I , Holroyd N , Jagels K , Lord A , Moule S , Mungall K , Norbertczak H , Quail MA , Rabbinowitsch E , Walker D , White B , Whitehead S , Small PL , Brosch R , Ramakrishnan L , Fischbach MA , Parkhill J , Cole ST
Ref : Genome Res , 18 :729 , 2008
Abstract : Stinear_2008_Genome.Res_18_729
ESTHER : Stinear_2008_Genome.Res_18_729
PubMedSearch : Stinear_2008_Genome.Res_18_729
PubMedID: 18403782
Gene_locus related to this paper: mycmm-b2hds9 , mycmm-b2hed7 , mycmm-b2hg81 , mycmm-b2hgg2 , mycmm-b2hgg7 , mycmm-b2hhi7 , mycmm-b2hhu3 , mycmm-b2hiu3 , mycmm-b2hiu5 , mycmm-b2hiw7 , mycmm-b2hiy0 , mycmm-b2hj55 , mycmm-b2hjb4 , mycmm-b2hju3 , mycmm-b2hku1 , mycmm-b2hkw0 , mycmm-b2hlr0 , mycmm-b2hlt7 , mycmm-b2hlt8 , mycmm-b2hlt9 , mycmm-b2hlu0 , mycmm-b2hlv0 , mycmm-b2hlv1 , mycmm-b2hlv2 , mycmm-b2hlx2 , mycmm-b2hm55 , mycmm-b2hnr9 , mycmm-b2hnz5 , mycmm-b2hp80 , mycmm-b2hpp0 , mycmm-b2hq96 , mycmm-b2hr10 , mycmm-b2hsm6 , mycmm-b2hsm8 , mycmm-b2hsy0 , mycmm-b2ht06 , mycmm-b2ht20 , mycmm-b2ht49 , mycmm-dhma , mycmm-metx , mycmr-q5sdq4 , myctu-RV1683 , mycmm-b2h1k1 , mycua-a0pku2 , mycua-a0pl47 , mycua-a0plr3 , mycua-a0pm12 , mycua-a0pm14 , mycua-a0pmv0 , mycua-a0pmx9 , mycua-a0pn71 , mycua-a0ppm6 , mycua-a0pqm2 , mycua-a0pqs2 , mycua-a0prq2 , mycua-a0psb1 , mycua-a0psb4 , mycua-a0psi2 , mycua-a0pth6 , mycua-a0ptq0 , mycua-a0pu55 , mycua-a0pum4 , mycua-a0pv11 , mycua-a0pva4 , mycua-a0pwi8 , mycua-a0pwr6 , mycua-a0pwz5 , mycul-a85a , mycmm-b2hcy1 , mycua-a0pvg7 , mycmm-b2hnj4 , mycmm-b2he93 , mycua-a0pwz4 , mycmm-b2hqy3 , mycua-a0pmc3 , mycmm-b2hnn7 , mycmm-b2he68 , mycmm-b2hqm3 , mycmm-tesa

Title : Genome plasticity of BCG and impact on vaccine efficacy - Brosch_2007_Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A_104_5596
Author(s) : Brosch R , Gordon SV , Garnier T , Eiglmeier K , Frigui W , Valenti P , Dos Santos S , Duthoy S , Lacroix C , Garcia-Pelayo C , Inwald JK , Golby P , Garcia JN , Hewinson RG , Behr MA , Quail MA , Churcher C , Barrell BG , Parkhill J , Cole ST
Ref : Proc Natl Acad Sci U S A , 104 :5596 , 2007
Abstract : Brosch_2007_Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A_104_5596
ESTHER : Brosch_2007_Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A_104_5596
PubMedSearch : Brosch_2007_Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A_104_5596
PubMedID: 17372194
Gene_locus related to this paper: myctu-a85a , myctu-a85b , myctu-a85c , myctu-bpoC , myctu-cut3 , myctu-cutas2 , myctu-d5yk66 , myctu-ephB , myctu-ephc , myctu-ephd , myctu-ephE , myctu-hpx , myctu-linb , myctu-lipG , myctu-lipJ , myctu-LIPS , myctu-lipv , myctu-LPQC , myctu-LPQP , myctu-MBTB , myctu-metx , myctu-mpt51 , myctu-MT1628 , myctu-p71654 , myctu-p95011 , myctu-PKS6 , myctu-PKS13 , myctu-ppe42 , myctu-ppe63 , myctu-Rv1430 , myctu-RV0045C , myctu-Rv0077c , myctu-Rv0151c , myctu-Rv0152c , myctu-Rv0159c , myctu-Rv0160c , myctu-rv0183 , myctu-Rv0217c , myctu-Rv0220 , myctu-Rv0272c , myctu-RV0293C , myctu-RV0457C , myctu-RV0519C , myctu-RV0774C , myctu-RV0782 , myctu-RV0840C , myctu-Rv1069c , myctu-Rv1076 , myctu-RV1123C , myctu-Rv1184c , myctu-Rv1191 , myctu-RV1192 , myctu-RV1215C , myctu-Rv1399c , myctu-Rv1400c , myctu-Rv1426c , myctu-RV1639C , myctu-RV1683 , myctu-RV1758 , myctu-Rv1800 , myctu-Rv1833c , myctu-Rv2045c , myctu-RV2054 , myctu-Rv2284 , myctu-RV2296 , myctu-Rv2385 , myctu-Rv2485c , myctu-RV2627C , myctu-RV2672 , myctu-RV2695 , myctu-RV2765 , myctu-RV2800 , myctu-RV2854 , myctu-Rv2970c , myctu-Rv3084 , myctu-Rv3097c , myctu-rv3177 , myctu-Rv3312c , myctu-RV3452 , myctu-RV3473C , myctu-Rv3487c , myctu-Rv3569c , myctu-Rv3591c , myctu-RV3724 , myctu-Rv3802c , myctu-Rv3822 , myctu-y0571 , myctu-y963 , myctu-Y1834 , myctu-y1835 , myctu-y2079 , myctu-yc88 , myctu-ym23 , myctu-ym24 , myctu-YR15 , myctu-yt28

Title : Reductive evolution and niche adaptation inferred from the genome of Mycobacterium ulcerans, the causative agent of Buruli ulcer - Stinear_2007_Genome.Res_17_192
Author(s) : Stinear TP , Seemann T , Pidot S , Frigui W , Reysset G , Garnier T , Meurice G , Simon D , Bouchier C , Ma L , Tichit M , Porter JL , Ryan J , Johnson PD , Davies JK , Jenkin GA , Small PL , Jones LM , Tekaia F , Laval F , Daffe M , Parkhill J , Cole ST
Ref : Genome Res , 17 :192 , 2007
Abstract : Stinear_2007_Genome.Res_17_192
ESTHER : Stinear_2007_Genome.Res_17_192
PubMedSearch : Stinear_2007_Genome.Res_17_192
PubMedID: 17210928
Gene_locus related to this paper: mycmm-b2hds9 , mycmm-b2hg81 , mycmm-b2hgg2 , mycmm-b2hj55 , mycmm-b2hju3 , mycmm-b2hlr0 , mycmm-b2hlv2 , mycmm-b2hq96 , mycmm-b2hsm8 , mycmr-q5sdq4 , myctu-RV1683 , mycua-a0pkg7 , mycua-a0pki1 , mycua-a0pkn2 , mycua-a0pkn5 , mycua-a0pku2 , mycua-a0pl47 , mycua-a0plr3 , mycua-a0plu8 , mycua-a0ply4 , mycua-a0pm12 , mycua-a0pm14 , mycua-a0pme3 , mycua-a0pmj6 , mycua-a0pml9 , mycua-a0pmv0 , mycua-a0pmx9 , mycua-a0pn71 , mycua-a0png7 , mycua-a0png9 , mycua-a0pp56 , mycua-a0ppm6 , mycua-a0pqm2 , mycua-a0pqs2 , mycua-a0pr64 , mycua-a0pr98 , mycua-a0prq2 , mycua-a0prr7 , mycua-a0psb1 , mycua-a0psb4 , mycua-a0psi2 , mycua-a0psi3 , mycua-a0psu3 , mycua-a0pt08 , mycua-a0pt71 , mycua-a0pth6 , mycua-a0ptq0 , mycua-a0pu55 , mycua-a0pum4 , mycua-a0pv11 , mycua-a0pv36 , mycua-a0pv77 , mycua-a0pva4 , mycua-a0pwi8 , mycua-a0pwm4 , mycua-a0pwr6 , mycua-a0pwz5 , mycua-a0px52 , mycua-metx , mycua-a0pmc2 , mycua-a0pvg7 , mycua-a0pwz4 , mycmm-b2hqy3 , mycua-a0pmc3

Title : Functional analysis and annotation of the virulence plasmid pMUM001 from Mycobacterium ulcerans - Stinear_2005_Microbiology_151_683
Author(s) : Stinear TP , Pryor MJ , Porter JL , Cole ST
Ref : Microbiology , 151 :683 , 2005
Abstract : Stinear_2005_Microbiology_151_683
ESTHER : Stinear_2005_Microbiology_151_683
PubMedSearch : Stinear_2005_Microbiology_151_683
PubMedID: 15758215

Title : Giant plasmid-encoded polyketide synthases produce the macrolide toxin of Mycobacterium ulcerans - Stinear_2004_Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A_101_1345
Author(s) : Stinear TP , Mve-Obiang A , Small PL , Frigui W , Pryor MJ , Brosch R , Jenkin GA , Johnson PD , Davies JK , Lee RE , Adusumilli S , Garnier T , Haydock SF , Leadlay PF , Cole ST
Ref : Proc Natl Acad Sci U S A , 101 :1345 , 2004
Abstract : Stinear_2004_Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A_101_1345
ESTHER : Stinear_2004_Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A_101_1345
PubMedSearch : Stinear_2004_Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A_101_1345
PubMedID: 14736915

Title : The complete genome sequence of Mycobacterium bovis - Garnier_2003_Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A_100_7877
Author(s) : Garnier T , Eiglmeier K , Camus JC , Medina N , Mansoor H , Pryor M , Duthoy S , Grondin S , Lacroix C , Monsempe C , Simon S , Harris B , Atkin R , Doggett J , Mayes R , Keating L , Wheeler PR , Parkhill J , Barrell BG , Cole ST , Gordon SV , Hewinson RG
Ref : Proc Natl Acad Sci U S A , 100 :7877 , 2003
Abstract : Garnier_2003_Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A_100_7877
ESTHER : Garnier_2003_Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A_100_7877
PubMedSearch : Garnier_2003_Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A_100_7877
PubMedID: 12788972
Gene_locus related to this paper: myctu-a85a , myctu-a85b , myctu-a85c , myctu-bpoC , myctu-cut3 , myctu-cutas1 , myctu-cutas2 , myctu-d5yk66 , myctu-ephB , myctu-ephc , myctu-ephd , myctu-ephE , myctu-hpx , myctu-linb , myctu-lipG , myctu-lipJ , myctu-LIPS , myctu-lipv , myctu-LPQC , myctu-LPQP , myctu-MBTB , myctu-metx , myctu-mpt51 , myctu-MT1628 , myctu-MT3441 , myctu-p71654 , myctu-p95011 , myctu-PKS6 , myctu-PKS13 , myctu-ppe42 , myctu-ppe63 , myctu-Rv1430 , myctu-RV0045C , myctu-Rv0077c , myctu-Rv0151c , myctu-Rv0152c , myctu-Rv0159c , myctu-Rv0160c , myctu-rv0183 , myctu-Rv0217c , myctu-Rv0220 , myctu-Rv0272c , myctu-RV0293C , myctu-RV0421C , myctu-RV0457C , myctu-RV0519C , myctu-RV0774C , myctu-RV0782 , myctu-RV0840C , myctu-Rv1069c , myctu-Rv1076 , myctu-RV1123C , myctu-Rv1184c , myctu-Rv1190 , myctu-Rv1191 , myctu-RV1192 , myctu-RV1215C , myctu-Rv1399c , myctu-Rv1400c , myctu-Rv1426c , myctu-RV1639C , myctu-RV1683 , myctu-RV1758 , myctu-Rv1800 , myctu-Rv1833c , myctu-Rv2045c , myctu-RV2054 , myctu-Rv2284 , myctu-RV2296 , myctu-Rv2385 , myctu-Rv2485c , myctu-RV2627C , myctu-RV2672 , myctu-RV2695 , myctu-RV2765 , myctu-RV2800 , myctu-RV2854 , myctu-Rv2970c , myctu-Rv3084 , myctu-Rv3097c , myctu-rv3177 , myctu-Rv3312c , myctu-RV3452 , myctu-RV3473C , myctu-Rv3487c , myctu-Rv3569c , myctu-RV3724 , myctu-Rv3802c , myctu-Rv3822 , myctu-y0571 , myctu-y963 , myctu-Y1834 , myctu-y1835 , myctu-y2079 , myctu-Y2307 , myctu-yc88 , myctu-ym23 , myctu-ym24 , myctu-YR15 , myctu-yt28

Title : Re-annotation of the genome sequence of Mycobacterium tuberculosis H37Rv - Camus_2002_Microbiology_148_2967
Author(s) : Camus JC , Pryor MJ , Medigue C , Cole ST
Ref : Microbiology , 148 :2967 , 2002
Abstract : Camus_2002_Microbiology_148_2967
ESTHER : Camus_2002_Microbiology_148_2967
PubMedSearch : Camus_2002_Microbiology_148_2967
PubMedID: 12368430
Gene_locus related to this paper: myctu-d5yk66 , myctu-ephA , myctu-ephB , myctu-LPQP , myctu-p71654 , myctu-Rv0160c , myctu-RV0774C , myctu-Rv2485c , myctu-RV2672 , myctu-RV2695 , myctu-RV2765 , myctu-RV2800 , myctu-Rv2970c , myctu-Rv3084 , myctu-Rv3097c , myctu-RV3452

Title : Identification of novel VirR\/VirS-regulated genes in Clostridium perfringens - Banu_2000_Mol.Microbiol_35_854
Author(s) : Banu S , Ohtani K , Yaguchi H , Swe T , Cole ST , Hayashi H , Shimizu T
Ref : Molecular Microbiology , 35 :854 , 2000
Abstract : Banu_2000_Mol.Microbiol_35_854
ESTHER : Banu_2000_Mol.Microbiol_35_854
PubMedSearch : Banu_2000_Mol.Microbiol_35_854
PubMedID: 10692162
Gene_locus related to this paper: clope-lipa

Title : Identification of variable regions in the genomes of tubercle bacilli using bacterial artificial chromosome arrays - Gordon_1999_Mol.Microbiol_32_643
Author(s) : Gordon SV , Brosch R , Billault A , Garnier T , Eiglmeier K , Cole ST
Ref : Molecular Microbiology , 32 :643 , 1999
Abstract : Gordon_1999_Mol.Microbiol_32_643
ESTHER : Gordon_1999_Mol.Microbiol_32_643
PubMedSearch : Gordon_1999_Mol.Microbiol_32_643
PubMedID: 10320585
Gene_locus related to this paper: myctu-RV1758

Title : Deciphering the biology of Mycobacterium tuberculosis from the complete genome sequence - Cole_1998_Nature_393_537
Author(s) : Cole ST , Brosch R , Parkhill J , Garnier T , Churcher C , Harris D , Gordon SV , Eiglmeier K , Gas S , Barry CE, 3rd , Tekaia F , Badcock K , Basham D , Brown D , Chillingworth T , Connor R , Davies R , Devlin K , Feltwell T , Gentles S , Hamlin N , Holroyd S , Hornsby T , Jagels K , Krogh A , McLean J , Moule S , Murphy L , Oliver K , Osborne J , Quail MA , Rajandream MA , Rogers J , Rutter S , Seeger K , Skelton J , Squares R , Squares S , Sulston JE , Taylor K , Whitehead S , Barrell BG
Ref : Nature , 393 :537 , 1998
Abstract : Cole_1998_Nature_393_537
ESTHER : Cole_1998_Nature_393_537
PubMedSearch : Cole_1998_Nature_393_537
PubMedID: 9634230
Gene_locus related to this paper: myctu-a85a , myctu-a85b , myctu-a85c , myctu-bpoC , myctu-cut3 , myctu-cutas1 , myctu-cutas2 , myctu-d5yk66 , myctu-ephA , myctu-ephB , myctu-ephc , myctu-ephd , myctu-ephE , myctu-ephF , myctu-hpx , myctu-linb , myctu-lipG , myctu-lipJ , myctu-LIPS , myctu-lipv , myctu-LPQC , myctu-LPQP , myctu-MBTB , myctu-metx , myctu-mpt51 , myctu-MT1628 , myctu-MT3441 , myctu-p71654 , myctu-p95011 , myctu-PKS6 , myctu-PKS13 , myctu-ppe42 , myctu-ppe63 , myctu-Rv1430 , myctu-RV0045C , myctu-Rv0077c , myctu-Rv0151c , myctu-Rv0152c , myctu-Rv0159c , myctu-Rv0160c , myctu-rv0183 , myctu-Rv0217c , myctu-Rv0220 , myctu-Rv0272c , myctu-RV0293C , myctu-RV0421C , myctu-RV0457C , myctu-RV0519C , myctu-RV0774C , myctu-RV0782 , myctu-RV0840C , myctu-Rv1069c , myctu-Rv1076 , myctu-RV1123C , myctu-Rv1184c , myctu-Rv1190 , myctu-Rv1191 , myctu-RV1192 , myctu-RV1215C , myctu-Rv1399c , myctu-Rv1400c , myctu-Rv1426c , myctu-RV1639C , myctu-RV1683 , myctu-RV1758 , myctu-Rv1800 , myctu-Rv1833c , myctu-RV2054 , myctu-RV2296 , myctu-Rv2385 , myctu-Rv2485c , myctu-RV2627C , myctu-RV2672 , myctu-RV2695 , myctu-RV2765 , myctu-RV2800 , myctu-RV2854 , myctu-Rv2970c , myctu-Rv3084 , myctu-Rv3097c , myctu-rv3177 , myctu-Rv3312c , myctu-RV3452 , myctu-RV3473C , myctu-Rv3487c , myctu-Rv3569c , myctu-Rv3591c , myctu-RV3724 , myctu-Rv3802c , myctu-Rv3822 , myctu-y0571 , myctu-y963 , myctu-Y1834 , myctu-y1835 , myctu-y2079 , myctu-Y2307 , myctu-yc88 , myctu-ym23 , myctu-ym24 , myctu-YR15 , myctu-yt28

Title : An integrated map of the genome of the tubercle bacillus, Mycobacterium tuberculosis H37Rv, and comparison with Mycobacterium leprae - Philipp_1996_Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A_93_3132
Author(s) : Philipp WJ , Poulet S , Eiglmeier K , Pascopella L , Balasubramanian V , Heym B , Bergh S , Bloom BR , Jacobs WR, Jr. , Cole ST
Ref : Proc Natl Acad Sci U S A , 93 :3132 , 1996
Abstract : Philipp_1996_Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A_93_3132
ESTHER : Philipp_1996_Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A_93_3132
PubMedSearch : Philipp_1996_Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A_93_3132
PubMedID: 8610181
Gene_locus related to this paper: myctu-Rv0217c , myctu-Rv0220 , myctu-Rv1076 , myctu-Rv1399c , myctu-Rv1400c , myctu-Rv1426c , myctu-Rv2045c , myctu-Rv2284 , myctu-Rv2385 , myctu-Rv2485c , myctu-Rv2970c , myctu-Rv3084 , myctu-Rv3097c , myctu-Rv3487c

Title : Genomic organization of the mycobacterial sigma gene cluster - Doukhan_1995_Gene_165_67
Author(s) : Doukhan L , Predich M , Nair G , Dussurget O , Mandic-Mulec I , Cole ST , Smith DR , Smith I
Ref : Gene , 165 :67 , 1995
Abstract : Doukhan_1995_Gene_165_67
ESTHER : Doukhan_1995_Gene_165_67
PubMedSearch : Doukhan_1995_Gene_165_67
PubMedID: 7489918
Gene_locus related to this paper: mycle-LPQC

Title : Use of an ordered cosmid library to deduce the genomic organization of Mycobacterium leprae - Eiglmeier_1993_Mol.Microbiol_7_197
Author(s) : Eiglmeier K , Honore N , Woods SA , Caudron B , Cole ST
Ref : Molecular Microbiology , 7 :197 , 1993
Abstract : Eiglmeier_1993_Mol.Microbiol_7_197
ESTHER : Eiglmeier_1993_Mol.Microbiol_7_197
PubMedSearch : Eiglmeier_1993_Mol.Microbiol_7_197
PubMedID: 8446027
Gene_locus related to this paper: mycle-MLC1351.21C , mycle-MLCB22.16c , mycle-PTRB , mycle-tpea