Seki_2009_Vaccine_27_1710

Reference

Title : Whole genome sequence analysis of Mycobacterium bovis bacillus Calmette-Guerin (BCG) Tokyo 172: a comparative study of BCG vaccine substrains - Seki_2009_Vaccine_27_1710
Author(s) : Seki M , Honda I , Fujita I , Yano I , Yamamoto S , Koyama A
Ref : Vaccine , 27 :1710 , 2009
Abstract :

To investigate the molecular characteristics of bacillus Calmette-Guerin (BCG) vaccines, the complete genomic sequence of Mycobacterium bovis BCG Tokyo 172 was determined, and the results were compared with those for BCG Pasteur and other M. tuberculosis complex. The genome of BCG Tokyo had a length of 4,371,711bp and contained 4033 genes, including 3950 genes coding for proteins (CDS). There were 18 regions of difference (showing differences of more than 20bp), 20 insertion or deletion (ins/del) mutations of less than 20bp, and 68 SNPs between the two BCG substrains. These findings are useful for better understanding of the genetic differences in BCG substrains due to in vitro evolution of BCG.

PubMedSearch : Seki_2009_Vaccine_27_1710
PubMedID: 19200449
Gene_locus related to this paper: myctu-a85a , myctu-a85b , myctu-a85c , myctu-bpoC , myctu-cut3 , myctu-cutas1 , myctu-cutas2 , myctu-d5yk66 , myctu-ephB , myctu-ephc , myctu-ephd , myctu-ephE , myctu-hpx , myctu-linb , myctu-lipG , myctu-lipJ , myctu-LIPS , myctu-lipv , myctu-LPQC , myctu-LPQP , myctu-MBTB , myctu-metx , myctu-mpt51 , myctu-MT1628 , myctu-MT3441 , myctu-p71654 , myctu-p95011 , myctu-PKS6 , myctu-PKS13 , myctu-ppe42 , myctu-ppe63 , myctu-Rv1430 , myctu-RV0045C , myctu-Rv0077c , myctu-Rv0151c , myctu-Rv0152c , myctu-Rv0159c , myctu-Rv0160c , myctu-rv0183 , myctu-Rv0217c , myctu-Rv0220 , myctu-Rv0272c , myctu-RV0293C , myctu-RV0457C , myctu-RV0519C , myctu-RV0774C , myctu-RV0782 , myctu-RV0840C , myctu-Rv1069c , myctu-Rv1076 , myctu-RV1123C , myctu-Rv1184c , myctu-Rv1190 , myctu-Rv1191 , myctu-RV1192 , myctu-RV1215C , myctu-Rv1399c , myctu-Rv1400c , myctu-Rv1426c , myctu-RV1639C , myctu-RV1683 , myctu-RV1758 , myctu-Rv1800 , myctu-Rv1833c , myctu-Rv2045c , myctu-RV2054 , myctu-RV2296 , myctu-Rv2385 , myctu-RV2627C , myctu-RV2672 , myctu-RV2695 , myctu-RV2765 , myctu-RV2800 , myctu-RV2854 , myctu-Rv2970c , myctu-Rv3084 , myctu-Rv3097c , myctu-rv3177 , myctu-Rv3312c , myctu-RV3452 , myctu-RV3473C , myctu-Rv3487c , myctu-Rv3569c , myctu-Rv3591c , myctu-RV3724 , myctu-Rv3802c , myctu-Rv3822 , myctu-y0571 , myctu-y963 , myctu-Y1834 , myctu-y1835 , myctu-y2079 , myctu-yc88 , myctu-ym23 , myctu-ym24 , myctu-YR15 , myctu-yt28

Related information

Gene_locus myctu-a85a    myctu-a85b    myctu-a85c    myctu-bpoC    myctu-cut3    myctu-cutas1    myctu-cutas2    myctu-d5yk66    myctu-ephB    myctu-ephc    myctu-ephd    myctu-ephE    myctu-hpx    myctu-linb    myctu-lipG    myctu-lipJ    myctu-LIPS    myctu-lipv    myctu-LPQC    myctu-LPQP    myctu-MBTB    myctu-metx    myctu-mpt51    myctu-MT1628    myctu-MT3441    myctu-p71654    myctu-p95011    myctu-PKS6    myctu-PKS13    myctu-ppe42    myctu-ppe63    myctu-Rv1430    myctu-RV0045C    myctu-Rv0077c    myctu-Rv0151c    myctu-Rv0152c    myctu-Rv0159c    myctu-Rv0160c    myctu-rv0183    myctu-Rv0217c    myctu-Rv0220    myctu-Rv0272c    myctu-RV0293C    myctu-RV0457C    myctu-RV0519C    myctu-RV0774C    myctu-RV0782    myctu-RV0840C    myctu-Rv1069c    myctu-Rv1076    myctu-RV1123C    myctu-Rv1184c    myctu-Rv1190    myctu-Rv1191    myctu-RV1192    myctu-RV1215C    myctu-Rv1399c    myctu-Rv1400c    myctu-Rv1426c    myctu-RV1639C    myctu-RV1683    myctu-RV1758    myctu-Rv1800    myctu-Rv1833c    myctu-Rv2045c    myctu-RV2054    myctu-RV2296    myctu-Rv2385    myctu-RV2627C    myctu-RV2672    myctu-RV2695    myctu-RV2765    myctu-RV2800    myctu-RV2854    myctu-Rv2970c    myctu-Rv3084    myctu-Rv3097c    myctu-rv3177    myctu-Rv3312c    myctu-RV3452    myctu-RV3473C    myctu-Rv3487c    myctu-Rv3569c    myctu-Rv3591c    myctu-RV3724    myctu-Rv3802c    myctu-Rv3822    myctu-y0571    myctu-y963    myctu-Y1834    myctu-y1835    myctu-y2079    myctu-yc88    myctu-ym23    myctu-ym24    myctu-YR15    myctu-yt28
Gene_locus_frgt myctu-a85a    myctu-a85b    myctu-a85c    myctu-bpoC    myctu-cut3    myctu-cutas1    myctu-cutas2    myctu-d5yk66    myctu-ephB    myctu-ephc    myctu-ephd    myctu-ephE    myctu-hpx    myctu-linb    myctu-lipG    myctu-lipJ    myctu-LIPS    myctu-lipv    myctu-LPQC    myctu-LPQP    myctu-MBTB    myctu-metx    myctu-mpt51    myctu-MT1628    myctu-MT3441    myctu-p71654    myctu-p95011    myctu-PKS6    myctu-PKS13    myctu-ppe42    myctu-ppe63    myctu-Rv1430    myctu-RV0045C    myctu-Rv0077c    myctu-Rv0151c    myctu-Rv0152c    myctu-Rv0159c    myctu-Rv0160c    myctu-rv0183    myctu-Rv0217c    myctu-Rv0220    myctu-Rv0272c    myctu-RV0293C    myctu-RV0457C    myctu-RV0519C    myctu-RV0774C    myctu-RV0782    myctu-RV0840C    myctu-Rv1069c    myctu-Rv1076    myctu-RV1123C    myctu-Rv1184c    myctu-Rv1190    myctu-Rv1191    myctu-RV1192    myctu-RV1215C    myctu-Rv1399c    myctu-Rv1400c    myctu-Rv1426c    myctu-RV1639C    myctu-RV1683    myctu-RV1758    myctu-Rv1800    myctu-Rv1833c    myctu-Rv2045c    myctu-RV2054    myctu-RV2296    myctu-Rv2385    myctu-RV2627C    myctu-RV2672    myctu-RV2695    myctu-RV2765    myctu-RV2800    myctu-RV2854    myctu-Rv2970c    myctu-Rv3084    myctu-Rv3097c    myctu-rv3177    myctu-Rv3312c    myctu-RV3452    myctu-RV3473C    myctu-Rv3487c    myctu-Rv3569c    myctu-Rv3591c    myctu-RV3724    myctu-Rv3802c    myctu-Rv3822    myctu-y0571    myctu-y963    myctu-Y1834    myctu-y1835    myctu-y2079    myctu-yc88    myctu-ym23    myctu-ym24    myctu-YR15    myctu-yt28    myctu-Rv1104

Citations formats

Seki M, Honda I, Fujita I, Yano I, Yamamoto S, Koyama A (2009)
Whole genome sequence analysis of Mycobacterium bovis bacillus Calmette-Guerin (BCG) Tokyo 172: a comparative study of BCG vaccine substrains
Vaccine 27 :1710

Seki M, Honda I, Fujita I, Yano I, Yamamoto S, Koyama A (2009)
Vaccine 27 :1710